Tokyo Twilight Ghost Hunters é uma novela visual em formato de game que coloca os jogadores no papel de um estudante do ensino médio que foi recentemente transferido para o colégio Shinjuku, e se esforçar para cursar o segundo grau do ensino médio. Enquanto visitava o campus, o nosso protagonista infeliz e outro estudante são atacados por um espírito maligno.